徳島文理大学

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徳島文理大学短期大学部

【科目名】    バイオインフォマティクス(Bioinformatics)

科目番号10300担当教員名高橋 宏暢単位2単位
科目群専門必修・選択選択開講期前期集中対象年次1
授業概要
次世代シークエンサーの登場により、個々の遺伝情報が1日で得られる時代となり、様々な疾病(特に癌)に関与する遺伝子発現情報が明らかにされている。それらの情報を理解する上で必要となる知識がバイオインフォマティクスです。本講義では、基本的な遺伝子情報から学び、次世代シークエンサーにより得られる情報としてどのような種類のデータが得られるのか、さらにどのように解析されているか、原理と応用について理解する。
到達目標
授業計画授業形態授業時間外学習
【1】概論講義 
【2】DNA配列決定方法講義 
【3】アライメント(1)講義 
【4】アライメント(2)講義 
【5】データーベース(1)講義 
【6】データーベース(2)講義 
【7】系統樹(1)講義 
【8】系統樹(2)講義 
【9】RNA二次構造講義 
【10】遺伝子予測講義 
【11】NGS(1)講義 
【12】NGS(2)講義 
【13】NGS(3)講義 
【14】NGS(4)講義 
【15】NGS(5)講義 
評価方法
課題レポート(60%)、討論(20%)および授業態度(20%)。評価内容は、講義中にお知らせする。
教科書
バイオインフォマティクス(メディカルサイエンスインターナショナル) 必要に応じて、プリントなどを配布
参考図書
バイオインフォマティクス(メディカルサイエンスインターナショナル)
備考
オフィスアワー:月曜日 17:00-18:00, 金曜日 17:00-18:00, 場所:21-1102